积极探索和推进后勤社会化改革，以契约形式对后勤服务中心和社会企业所承担的后勤服务工作进行管理、监督、检查和考核。代表学校测算、管理、调控、安排后勤经费。不断完善教职工住房制度改革，承担住房分配货币化工作的受理、核查、发放等工作，处理相关历史遗留问题。负责学校土地类和房屋类固定资产总帐的管理，统一办理房地产物业的对外产权变更、二级调配使用、增收节支等工作。负责学校水电煤等公用事业工作的内部管理与对外协调，推进校园节能降耗与减排环保工作。负责协调、组织、实施绿色校园、健康校园等专项创建工作。负责全校教室、会议室等公共物业的管理和相关服务协调，努力实现校园物业管理社会化、规范化、智能化。负责学校房屋类修缮工作计划的编制、报批与实施，统筹管理维修专项。在校综合治理委员会的指导下，负责开展安全生产和防汛防台工作。协同实验室与设备管理处、教务处负责校外实习实验基地的物业管理，为教学实习做好后勤保障。加强调研，向校领导提供后勤改革和发展的建议。
上海海洋大学后勤服务中心为全校师生提供后勤服务的实体单位。后勤服务中心设有综合管理部、人力资源部、计划财务部。并拥有饮食服务中心、社区管理中心、教学服务中心、接待服务中心、门诊部、交通服务部、能源与修建服务部和上海蔚海后勤服务有限公司等服务实体。中心整体通过ISO9001质量管理体系认证。曾获得上海市高校后勤社会化改革先进单位、2008年全国和上海市用户满意先进单位称号。现为中国质量协会企业会员、上海市质量协会会员单位。